He leído que la nueva versión de WordPress 2.7 generaba contenido duplicado debido a la nueva funcionalidad de paginación de los comentarios. Por suerte he encontrado a un desarrollador que había creado un simple plugin que soluciona este tema, se trata de SEO Comment Paging.

Instalación:
Descarguen el plugin desde el directorio de plugins de WordPress
Descompriman y suban a /wp-content/plugins/
Activen desde el panel de administración de plugins